في حين أن الهجرة إلى بلجيكا توفر العديد من المزايا، إلا أن هناك أيضاً بعض المساوئ التي يجب أخذها في الحسبان .يتمثل أحد التحديات في البيروقراطية والعمليات الإدارية المعقدة التي ينطوي عليها الحصول على التأشيرات وتصاريح الإقامة وغيرها من الوثائق الضرورية، والتي يمكن أن تستغرق وقتاُ طويلاً للوافدين الجدد. بالإضافة إلى ذلك، تتمتع بلجيكا بتكاليف معيشة مرتفعة نوعاً ما ، خاصة في المدن الكبرى مثل بروكسل وأنتويرب، مما قد يشكل تحديات مالية للمهاجرين، وخاصة ذوي الدخل المنخفض. قد يكون الاندماج في المجتمع البلجيكي صعباً أيضاً بالنسبة للبعض، حيث أن الحواجز اللغوية والاختلافات الثقافية قد تشكل عقبات أمام الأشخاص لكي يتكيفوا . علاوة على ذلك، فإن مناخ بلجيكا، الذي يتميز بالطقس البارد والممطر في كثير من الأحيان، قد لا يناسب تفضيلات الجميع. و أخيراً و ليس آخراً، تتمتع بلجيكا بنظام رعاية اجتماعية قوي، لكن قد يواجه بعض المهاجرين التمييز والتهميش، وخاصة في المناطق التي يكون سكانها من الفقراء.