هناك العديد من الجامعات في إسبانيا التي تقدم درجات البكالوريوس في الهندسة الطبية الحيوية أو المجالات ذات الصلة قمنا أدناه بذكر بعضاً من أفضل الجامعات لدراسة الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا:

• جامعة برشلونة: دراسة الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا في جامعة برشلونة تستغرق 4 سنوات و تتم دراسة هذا المجال في كلية الطب والعلوم الصحية في هذه الجامعة.
• جامعة بومبيو فابرا: دراسة الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا في جامعة بومبيو فابرا ممكنة أيضاً و تستغرق فترة 4 سنوات وسيدرس الطلاب في كلية الطب والعلوم الطبيعية بهذه الجامعة.
• جامعة كارلوس الثالث بمدريد: يهدف برنامج بكالوريوس الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا في جامعة كارلوس الثالث بمدريد إلى تدريب الأخصائيين في مجالات مختلفة، بما في ذلك تطوير وتصميم التقنيات الجديدة والأدوات والمستلزمات الطبية و معدات التصوير الدقيقة، بما في ذلك هندسة الأنسجة والطب التجديدي. يتم تنفيذ هذا البرنامج التعليمي خلال 4 سنوات ويحتاج المتقدمون إلى الحصول على درجة 5.5 في اختبار IELTS  .
• جامعة غرناطة: تمتد فترة دراسة بكالوريوسa الهندسة الطبية الحيوية في جامعة غرناطة بإسبانيا 3 سنوات و لغة الدراسة هي الإسبانية.

• جامعة برشلونة: تم تصميم برنامج دراسة الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا لدرجة الماجستير في جامعة برشلونة في عددٍ من المجالات المختلفة و الهدف منها تعليم الطلاب على: 
• التصميم والتصنيع والتقييم والتسويق والتركيب والصيانة المتعلقة بالخدمات والمنتجات الصحية والمعدات الطبية.
• تحضير الطلاب للقيام بالبحوث في مجال معين من الهندسة الطبية الحيوية.
• على الطلاب الراغبين في دراسة الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا لدرجة الماجستير في جامعة برشلونة الحصول على إحدى الوثائق التالية:
• الشهادة الاسبانية الرسمية.
• شهادة صادرة عن إحدى مؤسسات التعليم العالي في منطقة التعليم العالي الأوروبية والتي تسمح لحاملها بالدراسة في برنامج الماجستير في جامعة برشلونة في إسبانيا.
• شهادة من خارج منطقة التعليم العالي الأوروبية: في هذه الحالة، يجب أن تتم معادلة الشهادة التي حصل عليها الأشخاص حسب المؤهلات الإسبانية الرسمية. وفي حالة عدم الاعتراف بالشهادة ، يجب على جامعة برشلونة التصديق على أنها تتوافق مع المستوى التعليمي المعادل للمؤهلات الإسبانية الرسمية، مما يسمح لحاملها بدراسة الماجستير في الجامعة. وفي كل الأحوال فإن القبول في هذه الحالة لا يعني أن المؤهلات السابقة معترف بها على أنها معادلة لدرجة الماجستير الإسبانية وبالتالي لا يتم الاعتراف بها لأغراض أخرى غير القبول في برنامج الماجستير في جامعة برشلونة.
• جامعة فالنسيا: دراسة الهندسة الطبية الحيوية في إسبانيا لدرجة الماجستير متاحة في جامعة فالنسيا و هي لمدة عام باللغتين الإنجليزية والإسبانية.

أحد المؤسسات الرائدة في مجال أبحاث الطب الحيوي في إسبانيا هو معهد IRB Barcelona لأبحاث الطب الحيوي، وهو جزء من جامعة Autònoma de Barcelona (UAB) أو جامعة برشلونة المستقلة، والذي يقدم برنامج دكتوراه في الهندسة الطبية الحيوية الذي يهدف إلى تثقيف و تعليم الجيل القادم من العلماء الذين يقومون بأبحاث ممتازة لعلاج أمراض السرطان وغيرها من الأمراض المرتبطة بالشيخوخة. يضم البرنامج 28 مجموعة بحثية تعمل على موضوعات مثل البيولوجيا الخلوية والتطورية والطب الجزيئي والبيولوجيا الهيكلية والحاسوبية والبيولوجيا الكيميائية.

للتقدم لبرنامج الدكتوراه في العلوم الطبية الحيوية في إسبانيا، يلزم الحصول على درجة الماجستير أو ما يعادلها في مجال ذي صلة. بالإضافة إلى إجادة اللغة الإنجليزية بشكل ممتاز. كما يجب على المتقدم العثورعلى مشرف أكاديمي مناسب يمكنه توجيه المشروع البحثي وتوفير التمويل اللازم للبحث. كذلك يجب تقديم مقترح بحثي وسيرة ذاتية ونصوص أكاديمية أو بيان الدرجات و رسائل توصية. قد تختلف عملية القبول والمواعيد النهائية حسب البرنامج والمؤسسة.